Le système de certification PEFC repose sur la mise en place d’une traçabilité des bois, de la forêt jusqu’au produit fini, au sein de chaque entreprise, appelée certification de la chaîne de contrôle. Elle est délivrée par un organisme certificateur indépendant agréé par PEFC et accrédité par un organisme créé à l’initiative des pouvoirs publics, le COFRAC. Toute entreprise de transformation, de négoce ou de distribution de produits en bois ou à base de bois peut mettre en place une certification PEFC de sa chaîne de contrôle. Achats et ventes sont ainsi contrôlés et suivis pour assurer au client une fiabilité maximale. L’entreprise certifiée PEFC est ensuite contrôlée annuellement par un organisme certificateur sur le respect des règles de chaîne de contrôle et d’utilisation de la marque PEFC.